Wissenschaftler haben ein neues Verfahren entwickelt, mit dem sie das Zusammenspiel von Genen entschlüsseln. Verschiedene Gene können sich in ihrer Wirkung gegenseitig verstärken, abschwächen oder sogar ganz neutralisieren. Die Art und Weise wie dies geschieht, ähnelt der Methode, mit der die Internetplattform „Facebook“ Nutzern neue Freunde vorschlägt.
Ihre Ergebnisse stellen die Forscher um Michael Boutros vom Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) und Wolfgang Huber vom Europäischen Molekularbiologischen Labor (EMBL) in Heidelberg jetzt in der online-Ausgabe der Fachzeitschrift „Nature Methods“ vor.
Kombinationseffekte enthüllen
Viele Gene kommen in verschiedenen Menschen in verschiedenen Varianten vor. Um solche Varianten zu entdecken, die das Risiko für eine bestimmte Krankheit erhöhen, vergleichen Wissenschaftler die Gene von Patienten mit denen von gesunden Kontrollpersonen.
Doch häufig liefern diese Untersuchungen keine eindeutigen Ergebnisse: Denn der Effekt von bestimmten Erbgutvarianten hängt oft davon ab, ob auch andere Gene betroffen sind. Erst das Zusammenwirken von verschiedenen Genen hat Konsequenzen. Die nun von Boutros und Huber vorgestellte Methode kann diese Kombinationseffekte aufdecken.
„Freundes-Liste“ für Gene erstellt
Mit der so genannten RNA-Interferenz schalteten sie Gene einzeln und in allen paarweisen Kombinationen aus. Indem die Forscher systematisch alle Wechselwirkungen zwischen wichtigen Signalmolekülen katalogisierten, erhielten sie für jedes Gen eine detaillierte Liste von Interaktionspartnern, vergleichbar mit einer „Freundes-Liste“ im sozialen Netzwerk „Facebook“.
„Wenn zwei Nutzer von Facebook die gleichen Freunde haben, kann man mit hoher Wahrscheinlichkeit davon ausgehen, dass die beiden sich kennen – auch dann, wenn sie selbst nicht ‚Facebook-Freunde‘ sind“, erklärt Boutros. „Übertragen auf die Situation im Erbgut kann man durch den Vergleich ihrer Wechselwirkungen vorhersagen, welche Gene eine gemeinsame Funktion ausüben.“
Bald bessere Krebstherapien?
Boutros, Huber und ihre Kollegen können nun also „Freunde vorschlagen“, Gene, die sich in ihrer Wirkung beeinflussen. Zum Beispiel entdeckten die Forscher bei ihren Experimenten eine bislang unbekannte Komponente des RAS-Signalweges, der bei der Entstehung von Krebs eine wichtige Rolle spielt.
Diese neue Methode könnte deshalb nach Angaben der Wissenschaftler dazu beitragen, neue Komponenten krebsrelevanter Signalketten zu finden und damit mögliche Angriffspunkte für bessere Krebstherapien. (Nature Methods, 2011; doi:10.1038/nmeth.1581.)
(Deutsches Krebsforschungszentrum, 08.03.2011 – DLO)
